高層次超音波則是從頭到腳詳細檢查胎兒器官結構，檢查時間約40分鐘至1小時，視胎兒姿勢是否利於檢查而定。

三軍總醫院婦產部產科主任蘇河仰表示，高層次超音波是從頭到腳詳細檢查胎兒器官結構，準確率約8成，畢竟隔著肚皮檢查，再精密的儀器也有所侷限，但孕媽咪經常對此一檢查抱持高度期待。

如有的孕婦想知道「胎兒的骨頭數目對不對？」然而，骨頭數目並不在高層次超音波檢查項目之內；最常見的莫過於孕媽咪想知道「寶寶是不是都正常」，但產科醫師無法簡單的以「是」或「不是」回答，「即使結構正常，也可能存在功能性的問題，是否有功能異常問題必須在胎兒出生後才知道」，就像檢查確認沒有水腦問題，但不能了解聰明度為何；10根手指都有，卻無法確定靈巧度高低；電燈亮不亮，有時不是燈泡問題，而是線路問題，這個線路等同人體的「神經」，神經功能是否有異常並無法在胎兒時期得知，蘇河仰醫師強調，「沒有任何檢查能在胎兒時期就知道功能是否正常」。

由於深知孕媽咪對檢查充滿期待，讓執行檢查的產科醫師以更加慎重的措辭說明結果，而不會用「一切正常」當成最終的檢查結果，就是避免萬一孩子日後有功能異常的問題，父母用「醫師當時說一切正常」來興師問罪；更重要的是，「因為高層次超音波多在20至24週進行，當時看是正常，但有些問題卻在妊娠後期才發生，如：水腦、腎水腫，請父母了解胎兒的成長有如一段充滿動態變化的過程，過去的結論並不能解釋當下的狀況」。

由於愈來愈多孕媽咪會主動要求高層次超音波，蘇河仰醫師有以下提醒：

提醒1．及早告知檢查意願

確認懷孕後，若確定要接受此一自費檢查，「若在大醫院產檢的孕婦，請在第一次產檢時告知醫師，以及早排定檢查時間，因大醫院人力有限，可在院內接受檢查的名額極為有限，愈早告知才能愈早卡位。如果產檢診所未提供此檢查，可請醫師轉介其他醫療院所」。

提醒2．訓練認證合格者皆可放心

有時操作儀器的是超音波檢查技術員，而不是醫師，難免令媽咪不太放心，蘇河仰醫師表示，「不論是醫師或技術員，只要是訓練認證合格者都能操作儀器，即使是技術員檢查，報告仍是由醫師簽署負責，孕媽咪大可放心」。近年來，高層次超音波檢查的分工愈見細膩，「手腳部位可能由技術員檢查，精細部位則由醫師負責，或有異常狀況時，也會請醫師加以確認檢查」。

提醒3．檢查有異常可諮詢第二意見

若檢查有異常，需要醫師判斷異常的嚴重度，做為下一步怎麼走的依據，然而，隨著醫師的經驗值不同，判讀功力也有所差異，可能同一份報告，不同醫師有不同看法，蘇河仰醫師指出，「孕婦可尋求信任的醫師提供第二意見做為參考，以幫助自己做出最適當的決定」。