(2020.01更新) 林隆煌醫師說，「病從口入」，很多病菌都是從嘴巴吃進去的，腸道是身體裡細菌的大本營，出生時，腸道無菌，但逐漸累積發展，每個人的腸道發展出個別化的腸道共生菌叢。至於會出現哪些菌叢，則與環境、飲食、種族、基因和身體狀況等因素有關。

越來越多研究證實，腸內菌的種類和數量，與一個人健康和各種生理機能有著密切關係，透過益生菌，補充好菌，對抗壞的細菌，就可以改變腸道菌叢，並促進健康。 （推薦文章：益生菌顧消化護血脂．有效降低膽固醇）

林隆煌醫師指出，目前益生菌最常用來改善腸胃炎，可以改善腹瀉，縮短病情。少數研究則發現，益生菌可以用來改善過敏體質、舒緩功能性腹痛、改善胃食道逆流、減肥等。

許多家長都會讓小朋友服用益生菌，林隆煌醫師建議，購買時，應注意產品是否為衛生福利部認證的合格品牌，並選擇信譽良好的廠商，並注重保存方式和使用期限。

值得注意的是，益生菌絕非吃越多種，就越好，如果有效，只要1種就夠，如果1次吃很多種類的益生菌，可能導致各種菌種的菌相剋，有吃等於沒吃一樣，無法發揮益生菌的功效。

在劑量方面，應該遵守包裝上的食用方式和保存方式，或詢問醫師或藥師正確的使用方法，以免越吃越傷身。服用過量的益生菌，可能導致小腸細菌過度生長，引起噁心、嘔吐、腹脹、腹瀉、營養吸收不良等問題。

林隆煌醫師提醒，益生菌雖然並非藥物，但仍有潛在可能的危險和傷害，所以如果不清楚該怎麼吃，應該詢問醫師或藥師的專業意見，以免花錢買病受，那就得不償失。（推薦文章：維持腸道好菌相，媽媽寶寶都健康）