(2020.01更新)由於有些疾病必須長期藉由藥物控制，以使病情穩定，如：自體免疫疾病或精神疾病，所以，不論是準備懷孕或妊娠階段，對藥物的使用都要更加謹慎。（推薦文章：優生保健．孕前健康檢查）

自行停藥影響大

國泰醫院婦產科主任蔡明松指出，「自體免疫疾病有許多種類，每種疾病的致病機轉都不太一樣，懷孕後對不同自體免疫疾病造成的變化有所差異。有些會改善（如：類風溼性關節炎），有些則可能會惡化（如：紅斑性狼瘡）。建議懷孕期間必須於婦產科及內科門診定期追蹤，以利調整藥物及病情掌控」。甚至某些自體免疫疾病（如：紅斑性狼瘡），最好要在疾病控制良好下再懷孕，否則較易會有妊娠併發症（如：早產、妊娠高血壓、子癇前症、胎兒生長遲滯、胎死腹中）。

就精神疾病而言，蔡明松醫師表示，懷孕是重大的生活壓力，其造成的心理壓力、生活改變，和懷孕造成的各種荷爾蒙改變，皆有可能會加重精神疾病。雖然大部分的精神科藥物會通過胎盤，被分類為C或D級，但他提醒，「孕婦不要因為害怕吃藥對寶寶造成的影響而自行停藥」，因研究發現，如精神病未受良好控制，懷孕併發症、早產、以及寶寶出生體重不足、不良預後、嬰兒發育遲緩的風險均會較高。甚至在精神狀況惡化的狀況下，可能會做出自傷、自殺等的行為，後果更是嚴重。雖然在吃藥的狀況下，精神病仍有可能復發，但在有持續服藥的情況下，復發機率可大幅降低。

蔡明松醫師提醒，「完全不吃藥不是對胎兒和孕婦最好的方法，婦產科醫師和精神科醫師會衡量用藥的利弊，決定如何調整藥物」。

生產提醒．主動告知服藥狀況

因部分自體免疫疾病會使用到抗凝血藥物，蔡明松醫師指出，「孕媽咪在快分娩時，就分娩方式（自然產或剖腹產）與內科醫師討論是否需要調整藥物，也需向婦產科醫師主動告知自身藥物使用之狀況，以保證安全生產」。他以使用長期抗凝血劑如常用的Clexane（肝素）為例， 如需要剖腹產則要在剖腹產前至少12小時停藥，如需要接受緊急剖腹產時，孕婦應主動告知婦產科醫師有使用抗凝血劑之病史，以利做好萬全準備。

至於精神疾病，若孕婦承受不了精神疾病，甚至已有自殺傾向，則需和精神科、小兒科、孕婦與家屬進行多方會談，「畢竟媽媽和寶寶都很重要，我們不希望僅僅只為了寶寶而犧牲媽媽，必須衡量胎兒週數、媽媽精神狀況，討論生產時間」。（推薦文章：孕期用藥‧掌握8大原則）

考量哺乳與否

不論是自體免疫疾病或精神疾病，蔡明松醫師表示，「產後會考量媽媽是否需哺乳，將藥物調整成可以哺乳的藥物」。他補充，「產後也是精神疾病惡化的高峰期，研究顯示，讓精神疾病在產後拖愈久的時間，其嚴重度和預後皆會愈差」，適時追蹤非常重要。另外，孕婦在懷孕後期的生理轉變，可能會使藥物代謝有明顯變化，使藥物的血中濃度不穩定。而有暴露過這些藥物的新生兒，則需在新生兒科專門醫療評估與照護。（推薦文章：哺乳媽咪「藥」小心）